Изложены основные положения экологии водоемов (водной экологии) в системе естественных наук, предмет, цель, составные части, методы исследования. Рассмотрена история изучения водных экосистем в России и за рубежом, основные типы внутриконтинентальных водоемов. Анализируются основные элементы минерального питания водоемов и газовый режим. Отдельные разделы посвящены изучению основных компонентов экосистем водоемов, рассмотрены процессы жизнедеятельности гидробионтов, а также факторы стабилизации водных экосистем. Представлены некоторые аспекты функционирования водных экосистем, рассмотрена экологическая пластичность организмов в водной среде. Изложены принципы оценки загрязнения вод по показательным организмам, рассмотрены основные виды загрязнений экосистем водоемов. Предназначено для студентов-экологов, однако может быть полезно студентам и аспирантам биологических и географических специальностей, специалистам в области охраны природы.